假如上述健康療法仍無法舒緩經痛，建議進行藥物治療，包括三類藥物：
1.非類固醇式消炎藥或中樞止痛藥乙醯酚胺
非類固醇式消炎藥（NSAIDs，例如ibuprofen依普芬）有抑制前列腺素的效果，然而這類藥物恐有傷腎、傷胃與過敏的疑慮，所以使用前應先檢查是否有這方面的問題。服用這種藥物也會讓經血變少，但不用擔心會流不乾淨。另一種是常見的乙醯酚胺（Acetaminophen）（常稱普拿疼），效力一般沒有非類固醇式消炎藥來得有效，但有些人對非類固醇式消炎藥過敏時，則只能服用普拿疼。
這兩種藥物建議在經痛發生期間，規律性地6～8小時服用一顆來緩解經痛，千萬不要等到痛的時候才吃藥，以免來不及抑制經痛；若6～8小時服用一顆的劑量仍無法達到改善效果，也可合併服用肌肉鬆弛劑、平滑肌鬆弛劑，以增加這兩種止痛藥的止痛效果。
2.避孕藥（混合雌激素及黃體素）或調經藥
避孕藥會干擾正常的排卵，因此也會干擾子宮內膜的成熟，使內膜不會增生得太厚，可減少經血量和子宮收縮程度，能改善經痛。這類藥物的服用劑量及何種藥品較佳並沒有定論，所以會讓患者使用後視效果而定。然而有些女性在服用這類藥之後的下次經痛反而更嚴重，目前原因不明，但繼續使用第二個月、第三個月之後，即可改善經痛現象甚至消失。由於這類藥物仍有些副作用，例如體重增加、水腫、噁心、嘔吐、脹氣等，因此第一次使用時必須與婦產科醫師充分討論。
3.新型第四代黃體素
適用於子宮內膜異位症所造成經痛之藥物（Dienogest），主要是壓抑子宮內膜異位的增生、使病灶消失，對於緩解經痛的效果良好。宋醫師個人經驗顯示，若經痛患者沒有明顯的子宮內膜異位症，短時間服用此藥，也可能產生舒緩經痛的效果。
若是合併肌瘤或肌腺症引發的痛經，可使用「選擇性黃體接受器調節劑」（Ulipristal acetate）、性腺刺激素釋放素協同劑（俗稱停經針GnRH analogue）來治療；或是使用「子宮內投藥系統」的避孕器（塗有levonorgestrel的避孕器，一次可使用五年 ）治療，從病因進行藥物規劃。
中西醫可合併治療
沒有病灶的經痛，若是吃止痛藥的劑量越來越高、間隔時間越來越短，也可使用中醫的方法進行調整，但切勿自行買四物飲、中將湯之類的中藥來服用，務必請合格的中醫師經過把脈診斷之後再配中藥處方。
中藥、西藥可以在同一時期併行使用，只需相隔大約1～2小時即可，但必須向中醫師說明本身有在使用止痛或調經等西藥，因為有些中藥會干擾子宮內膜厚度的變化，恐影響婦產科醫師的診斷與釐清病因，不過只要患者與中西醫師進行良好的溝通就不至於產生問題。
吃止痛藥會傷身嗎？
有人主張經痛不要忍，但每次經痛就吃止痛藥到底好不好？首先必須先查明經痛的原因，若是可解決的問題，例如子宮內膜異位症、子宮肌瘤、肌腺症等，可服用上述第2類和第3類的非止痛藥物來治療。而且除非每天吃、連續吃一兩個月的止痛藥才可能傷身；假如果每個月只吃幾天、根據醫囑服用，並不會對身體造成影響。建議原發性經痛患者6～8小時規律地服用非類固醇式消炎藥或止痛藥來舒緩經痛。兩次服藥的間隔不要低於6小時，也就是不建議吃太多止痛藥，並記得多喝水、不要空腹服用。但若經痛症狀越來越嚴重，例如每4小時就必須服藥來止痛，此時務必尋求醫師協助，進入到第二階段藥物治療（例如避孕藥或子宮內膜異位症用藥）。
吃止痛藥會形成依賴性嗎？三項重點要注意
其實如果每個月只有幾天吃止痛藥來舒緩經痛，加上吃對時間──事先預服，就不會形成依賴藥物或服用劑量越來越重的狀況。因此必須認清三項重要觀念：
1.事先預服：
若能預知經痛即將來到，可以開始吃非類固醇式消炎藥或止痛藥來事先預防經痛。
2.不要擅自調整藥物劑量或間隔、不用害怕服藥：
如果發現服用止痛藥的劑量增加、間隔縮短，不可再自行調整，務必就醫使用別種治療方式來處理。有些人有乳癌家族病史，會害怕吃避孕藥或調經藥，可考慮使用停經針或自費的新型荷爾蒙藥物，或使用中醫療法來加以改善。
3.不要害怕手術：
若藥物已無法控制經痛，可和醫師進行充分討論，藉由手術方式來治療，例如施行神經阻斷術，或是切除子宮肌瘤、巧克力囊腫，肌腺症患者甚至考慮將子宮做部分摘除或全摘除，如此就不會再發生經痛。
另外還有電擊止經痛的方式，就是經皮神經電刺激（Transcutaneous electrical nerve stimulation, TENS），即俗稱的低週波。TENS為頻率1000赫茲以下的電刺激，分為高頻（50～120赫茲）與低頻（1～4赫茲）。根據過去研究顯示，高頻TENS似乎比安慰劑更有效地緩解疼痛，而低頻TENS效果可能並不優於安慰劑TENS。綜上所論，高頻TENS似乎是治療原發性經痛有效且安全的治療形式之一。
擔心止痛藥讓經血變少、排不乾淨？
有人擔心服用止痛藥會使經血變少，導致經血排不乾淨？其實是由於止痛藥造成子宮凝血及收縮，子宮收縮會關閉血管使經血量變少，但不用擔心經血排不乾淨的問題，因為經血是本身的血液，就算沒排乾淨也會自體吸收。
若真有經血排不乾淨的現象，要擔心的是子宮內膜增生問題，可與醫師討論，在患者經期過後評估子宮內膜的狀況。此外，鼓勵這類患者在懷孕時採用自然生產的方式，擴張子宮頸可望改善經痛；少部份會施行子宮內膜刮除，讓子宮頸稍微撐開，也能獲得改善。
經痛到何種程度需要就醫？
當經痛疼痛到需要服用藥物，或干擾到生活，例如無法工作或上學，那麼便需要就醫尋求協助，由醫師檢查造成經痛的病因再進行對症治療。還有部份女性原本沒有經痛，或是使用運動、瑜珈、服用健康食品就可舒緩，一旦疼痛程度突然劇增、發生頻率縮短、疼痛時間延長或提早發生，就必須趕緊就醫。
經痛情形嚴重時，排卵後即開始發生疼痛直到月經結束後的一週，經痛時間持續很久，就要擔心可能是子宮內膜異位症或骨盆腔發炎，骨盆腔發炎可透過內診檢查是否有不正常的分泌物來判斷；此外，子宮頸癌、子宮內膜癌與卵巢癌等癌病變也會讓原本的經痛日數拉長，同時合併陰道不正常出血，應提高警覺、立即就醫，不可等閒視之。
讓醫師幫助妳，和經痛說bye bye
經痛是很多女性的難言之隱，有些情況還能忍受，有些則完全無法忍受。如果從初經開始就無法忍受經痛，必須盡快就醫；若檢查並沒有發現疾病，自己要注意觀察每次月經來潮時，做哪些事可舒緩經痛，例如避免吃冰冷飲食、喝熱巧克力或熱黑糖薑茶等，歸納出「會」及「不會」造成經痛的情況來調整自我生活型態。
不要介意使用藥物來舒緩經痛，只要藥物治療良好，經痛也可能不再復發。而且不用擔心會一輩子依賴藥物，其實經痛就像高血壓、糖尿病等慢性疾病都需要使用藥物控制，否則可能造成慢性經痛、持續性經痛，將增加心理壓力和不愉快的經驗，便可能形成惱人的「經前症候群」。
因此如果經痛已經造成生活與工作上的身心壓力，就必須認真接受治療，甚至不排除使用手術療法，例如已經完成生育的女性，若是肌腺症、肌瘤、巧克力囊腫所產生的經痛一直造成負擔，也可採取手術方式以一勞永逸地解決。
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